Dentro de los estudios de agua subterránea que ha realizado el ICC, se han llevado a cabo dos campañas de muestreo de calidad química del agua con apoyo del instituto IHE Delft, Países Bajos, y el Instituto Superior Técnico de Lisboa, Portugal. En estos muestreos se han determinado propiedades fisicoquímicas de campo (pH, conductividad eléctrica, temperatura, oxígeno disuelto, salinidad, alcalinidad), organolépticas (color, olor, turbidez), composición iónica y de algunos compuestos clave que pueden tener origen en la actividad humana como nitratos y fosfatos para el sistema acuífero del abanico aluvial del volcán de Fuego. Esta información ha permitido analizar procesos de intrusión marina, fracción de agua marina, contaminación por nitratos y evaluar la calidad de agua subterránea para riego (Figura 12), así como comprender el movimiento del agua subterránea en el subsuelo.